Kong visszatért, és erősebb, mint valaha. A hatalmas emberszabású majom,
akit King Kong és ember "testvére" Jason génjeinek segítségével
támasztottak fel, saját királyságának ura. Egy sötét, ősi jóslat következtében
az elveszett Atlantisz valaha elsüllyedt szigete azonban ismét a felszínre
emelkedik, és gonosz királynőjének egyetlen vágya, hogy Kong: Atlantis
királya legyen ismét.
A bátor Jason és vakmerő barátai azonban szembeszállnak az uralkodónővel.
Küzdelmük során óriási állat-harcosokkal, titokzatos csapdákkal és lázadókkal
kerülnek szembe. Jasonnek a csaták hevében kell megpróbálnia egy különleges
eszköz segítségével egyesülnie Konggal, mert csak így menthetik meg a
szigetet és magát Kongot.